Pour guider ses actions, le COBAMIL s’appuie sur son Plan directeur de l’eau (PDE), un outil de planification stratégique fondé sur des données scientifiques, des consultations territoriales et des enjeux identifiés collectivement. Le PDE oriente les interventions à l’échelle du bassin versant, en tenant compte des réalités locales, de la qualité de l’eau, de l’aménagement du territoire, des usages et de la résilience face aux changements climatiques.